Данные недостатки устраняются в рамках инженерии ПрО, для домена которой создается характеристическая модель, которая учитывает изменчивость параметров и разных характеристик для группы программных подсистем. Инженерия ПрО использует методы инженерии приложения по использованию ПИК и включает процессы корректировки и моделирования характеристик ПрО и их изменяемости; использует другие модели (Use Case, модели взаимодействия, переходов и т.п.) и механизмы повторного использования ПИК (хранение, поиск, оценивание, объединение).
Инженерия приложений фактически предназначена для создания целевых одиночных ПС из соответствующего набора ПИК, а инженерия предметной области ставит задачу создания множества программных систем для ПрО (домена) и совокупностей ПрО с выделением в этой ПрО отдельных функций или группы функций для проектирования подсистем, обладающих общими свойствами и характеристиками для многоразового использования в других доменах этой совокупности ПрО.